Bibliographie 2018

Publications écrites

Cléach Jérôme, Watier, Denis, Le Fur Bruno, Brauge Thomas, Duflos Guillaume, Grard Thierry, Lencel Philippe, 2018. Use of ratiometric probes with a spectrofluorometer for bacterial viability measurement. Journal of Microbiology and Biotechnology, 28 (11) : 1782–1790. https://doi.org/10.4014/jmb.1804.04048 [ICV, LSA]

Delegrange Alice, Lefebvre Alain, Gohin Françis, Courcot Lucie, Vincent Dorothée, 2018. Pseudo-nitzschia sp. diversity and seasonality in the southern North Sea, domoic acid levels and associated phytoplankton communities. Estuarine Coastal And Shelf Science, 214 : 194–206. https://doi.org/10.1016/j.ecss.2018.09.030 [LERBL, LOG]

Denis Jérémy, Vincent Dorothée, Antajan Elvire, Vallet Carole, Mestre Julie, Lefebvre Valérie, Caboche Josselin, Cordier Rémy, Marchal Paul, Loots Christophe, 2018. Gut fluorescence technique to quantify pigment feeding in Downs herring larvae. Marine Ecology Progress Series, 607 : 129-142. https://doi.org/10.3354/meps12775 [LRHBL, LOG]

Hermabessiere Ludovic, Himber Charlotte, Boricaud Béatrice, Kazour Maria, Amara Rachid, Cassone Anne-Laure, Laurentie Michel, Paul-Pont Ika, Soudant Philippe, Dehaut Alexandre, Duflos Guillaume, 2018. Optimization, performance, and application of a pyrolysis-GC/MS method for the identification of microplastics. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 410 (25): 6663–6676. https://doi.org/10.1007/s00216-018-1279-0  https://hal-anses.archives-ouvertes.fr/anses-01874611 [ANSES LSA, LOG]

Il est important de connaître la composition exacte des microplastiques qui sont des particules de plastique ayant une taille inférieure à 5 mm pouvant polluer l’environnement. Le laboratoire de l’Anses possède un équipement capable de réaliser ce travail : un pyrolyseur couplé à un chromatographe en phase gazeuse et un spectromètre de masse (Py-GC/MS). Celui-ci permet de déstructurer, séparer et identifier les molécules qui composent le plastique. Cette étude a permis de tester les performances de cet appareil. Dans un premier temps, différents paramètres ont été réglés afin d’obtenir les meilleurs résultats possibles. Ensuite, les scientifiques se sont intéressés à évaluer si l’appareil donnait bien les mêmes résultats au cours du temps. Une fois ces deux approches réalisées, le laboratoire a testé la limite de détection de l’appareil, c’est-à-dire jusqu’à quelle masse de particule il est capable de reconnaître les plastiques. Cette masse est plus faible que 1 µg soit un million de fois plus léger qu’un gramme. Enfin lors d’une dernière étape, les performances de l’appareil ont été comparées avec celle d’un autre laboratoire du boulonnais (LOG), il apparaît que ces deux appareils sont complémentaires pour l’identification de microplastiques. La méthode a ensuite pu être utilisée sur des échantillons de l’environnement.

 

Karasiewicz Stéphane, Breton Elsa, Lefebvre Alain, Hernández Fariñas Tania, Lefebvre Sébastien, 2018.  Realized niche analysis of phytoplankton communities involving HAB: Phaeocystis spp. as a case study. Harmful Algae, 72: 1–13. https://doi.org/10.1016/j.hal.2017.12.005 [LERBL, LOG]

Le lien entre les efflorescences d’algues nuisibles, la dynamique des communautés phytoplanctoniques marines et les changements environnementaux sont encore mal connus. Afin d’éclaircir ces liens, les eaux côtières de la Manche orientale ont été utilisées comme étude de cas. Dans ces eaux, l’amplitude et l’intensité de l’efflorescence des diatomées et de l’algue nuisible, Phaeocystis spp., sont sujet à de grandes variabilités interannuelles potentiellement induites par une diminution progressive et continue des concentrations en sels nutritifs d’origine anthropique, une modification de leurs ratios ou bien une compétition pour les ressources entre les espèces. Une approche de niche écologique a été utilisée en étudiant la dynamique des sous-niches réalisées des espèces phytoplanctoniques durant des événements de fortes (H) et faibles (L) abondances annuelles de Phaeocystis spp. L’étude de ces contrastes a permis de dégager les conditions environnementales et les espèces de diatomées caractéristiques de ces événements. En particulier, des évolutions saisonnières différentes en salinité, en turbidité et en concentration des sels nutritifs ont été observées. Dans les deux cas, les conditions environnementales étaient favorables à Phaeocystis spp mais cette espèce a été sujette à une forte compétition pour les ressources avec certaines espèces de diatomées présentes durant la condition L. En revanche dans la condition H, les efflorescences de Phaeocystis spp ont pu être fortes malgré la présence d’un plus grand nombre d’autres espèces de diatomées. Les résultats suggèrent fortement que les interactions abiotiques et biotiques devraient être considérées simultanément dans les futures études d’efflorescence d’algues nuisibles en incluant le reste de la communauté phytoplanctonique.

Kazour Maria, Jemaa Sharif, El Rakwe Maria, Duflos Guillaume, Hermabassiere Ludovic, Dehaut Alexandre, Le Bihanic Florane, Cachot Jérôme, Cornille Vincent, Rabhi Khalef, Khalaf Gab, Amara Rachid, 2018. Juvenile fish caging as a tool for assessing microplastics contamination in estuarine fish nursery grounds. Environmental Science and Pollution Research, 27: 3548–3559. https://doi.org/10.1007/s11356-018-3345-8 [LSA, LOG]

Zeyer Estelle, Heuson Egon, Himber Charlotte, Phalip Vincent, Le Bris Cédric, Dhulster Pascal, Brisabois Anne, Flahaut Christophe, Cudennec Benoit, Grard Thierry, Duflos Guillaume, 2018. Novel approach to identify phenoloxidases inhibitors: Optimization of spectrophotometric MBTH assay for high throughput use enzymatic assays and analysis. Food Control, 93 : 83–91. https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2018.05.043 [ICV, LSA]

Zidour Mahammed, Belguesmia Yanath, Cudennec Benoit, Grard Thierry, Flahaut Christophe, Souissi Sami, Drider Djamel, 2018. Genome Sequencing and Analysis of Bacillus Pumilus ICVB403 Isolated from Acartia Tonsa Copepod Eggs Revealed Surfactin and Bacteriocin Production: Insights on Anti-Staphylococcus Activity. Probiotics and Antimicrobial Proteins, 11 (3): 990-998. https://doi.org/10.1007/s12602-018-9461-4 [ICV, LOG]

Pan Yen-Ju, Sadovskaya Irina, Hwang Ji-Sub, Souissi Sami, 2018. Assessment of the fecundity, population growth and fatty acid composition of Apocyclops royi (Cyclopoida, Copepoda) fed on different microalgal diets. Aquaculture Nutrition, 24 (3) : 970–978. https://doi.org/10.1111/anu.12633 [ICV, LOG]

Pan Yen-Ju, Sadovskaya Irina, Hwang Ji-Sub, Souissi Sami, 2018. Assessment of the fecundity, population growth and fatty acid composition of Apocyclops royi (Cyclopoida, Copepoda) fed on different microalgal diets. Aquaculture Nutrition, 24 (3) : 970–978. https://doi.org/10.1111/anu.12633 [ICV, LOG]

Mahe Kelig, Ider Djamila, Massaro Andréa, Hamed Oussama, Jurado-Ruzafa Alba, Gonçalves Patricia, Anastasopoulou Aikaterini, Jadaud Angélique, Mytilineou Chryssi, Elleboode Romain, Ramdane Zohir, Bacha Mahmoud, Amara Rachid, De Pontual Hélène, Ernande Bruno, 2018. Directional bilateral asymmetry in otolith morphology may affect fish stock discrimination based on otolith shape analysis. ICES Journal of Marine Science, 76 (1) : 232–243. https://doi.org/10.1093/icesjms/fsy163  HAL Id : hal-02439690 [LRHBL, LOG]